La chiesa venne completamente ristrutturata alla fine del Seicento da Francesco Glanio, vescovo di Sirmio in Ungheria, originario di Novate, grazie all'opera del capomastro intelvese Gian Maria Quaglio. All'interno affreschi di Giulio Quaglio (1696) e decorazione a stucco di Gerolamo Rossi (1685) e Girolamo Aliprandi (1697, tre campate della navata e due cappelle laterali).